تعمل المدارس المستقلة بشكل مستقل عن وزارة التعليم بمدينة نيويورك، الأمر الذي يمكنهم أن يكونوا أكثر مرونة في الطرق التي يديرون بها مدارسهم، وتصميم برامجهم الأكاديمية وتعيين الموظفين. لا يقتصر تركيز العديد من المدارس المستقلة على المواد الأساسية للغة الإنجليزية والرياضيات فحسب، بل تقدم أيضًا برامج للفنون والعلوم واللغة، وغالبًا ما تستخدم المدارس المستقلة مناهج مبتكرة للتعلم، مثل أيام دراسية أطول وسنة دراسية أطول، الأمر الذي يسهم في نجاح الطلاب في التحضير للكلية والوظيفة.