চার্টার স্কুলগুলি NYC শিক্ষাদপ্তর-এর থেকে স্বতন্ত্রভাবে কাজ করে। এটি স্কুলগুলিকে স্কুল পরিচালনা করা, নিজেদের শিক্ষাপদ্ধতি তৈরি করা এবং কর্মী নিয়োগ করার ব্যাপারে অনেক বেশি স্বাধীনতা প্রদান করে। বহু চার্টার স্কুল শুধুমাত্র ইংরেজি ও গণিতের মতো মূলগত বিষয়গুলির (core subjects) উপরেই জোর দেয় না, বরং তারা কলা, বিজ্ঞান ও ভাষা কার্যক্রমের উপরেএ সমান গুরুত্ব দিয়ে থাকে। চার্টার স্কুলগুলি সবসময়েই শিক্ষণের ক্ষেত্রে উদ্ভাবনীমূলক পদ্ধতিগুলিকে ব্যবহার করে থাকে, যেমন বেশি সময়ের স্কুলদিবস এবং বেশি দিনের শিক্ষাবর্ষ, যা শিক্ষার্থীদের তাদের কলেজ ও পেশাজীবনে সাফল্যের জন্য প্রস্তুত করে দিতে সাহায্য করে।